RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492698.1

LAMA5-211, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 3

Gene LAMA5, Length 894 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-211ENST00000492698 ACOT8O14734 319 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 SHC1P29353 583 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PEX19P40855 299 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 MTPNP58546 118 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 HBA1P69905 142 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 MS4A2Q01362 244 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 C17orf67Q0P5P2 114 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 GANABQ14697 944 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CLEC4FQ8N1N0 589 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 MEIOBQ8N635 442 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 COX18Q8N8Q8 333 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 OR4A15Q8NGL6 344 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 POC1BQ8TC44 478 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 OR5P2Q8WZ92 322 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ARSGQ96EG1 525 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 IKZF5Q9H5V7 419 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PTGES2Q9H7Z7 377 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 C3orf14Q9HBI5 128 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CLEC4AQ9UMR7 237 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.8□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ACANP16112 2415 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 DSCAMO60469 2012 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 TTC36A6NLP5 189 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 NDUFB5O43674 189 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 DNAJA2O60884 412 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ATE1O95260 518 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ANP32DO95626 131 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CGAP01215 116 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 C1QCP02747 245 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ALOX5P09917 674 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 TBXA2RP21731 343 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PRIM2P49643 509 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 GSK3BP49841 420 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 GZMMP51124 257 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ACTR3P61158 418 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 LIPEQ05469 1076 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 RIPK1Q13546 671 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CCNIQ14094 377 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 MLC1Q15049 377 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 GUSBP1Q15486 140 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PLPPR5Q32ZL2 321 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PPP4R4Q6NUP7 873 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF621Q6ZSS3 439 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF550Q7Z398 422 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CALHM3Q86XJ0 350 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 OR5AK3PQ8NH89 298 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 RNF145Q96MT1 663 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF583Q96ND8 569 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 FOXC2Q99958 501 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 SH3GL1Q99961 368 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PIGQQ9BRB3 760 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 PIGMQ9H3S5 423 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 SERHL2Q9H4I8 314 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 RNF122Q9H9V4 155 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 MED17Q9NVC6 651 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 GPATCH2Q9NW75 528 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 KLHL28Q9NXS3 571 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 TESMINQ9Y4I5 508 aa11.79□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 A0A0J9YW62 118 aa11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 CLIC1O00299 241 aa11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 MSTNO14793 375 aa11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 EFNA2O43921 213 aa11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ENTPD5O75356 428 aa11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 TNFRSF21O75509 655 aa11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 NGFRP08138 427 aa11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 GPX2P18283 190 aa11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 RPS26P62854 115 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF117Q03924 483 aa11.78□□□□□ -0.52
LAMA5-211ENST00000492698 TP53BP2Q13625 1128 aa11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms