RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 TPI1P60174 286 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TUSC3Q13454 348 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PTPRCAPQ14761 206 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR4D1Q15615 310 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HAGHQ16775 308 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DRAM2Q6UX65 266 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LGI4Q8N135 537 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 VOPP1Q96AW1 172 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KCNA7Q96RP8 456 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HBEGFQ99075 208 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NTMT1Q9BV86 223 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GGACTQ9BVM4 153 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 WWOXQ9NZC7 414 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OPN4Q9UHM6 478 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF225Q9UK10 706 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KCND3Q9UK17 655 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 X6R8D5 127 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MARCH11A6NNE9 402 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 B9A039 149 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 C9JVG2 144 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 E9PI62 339 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 STMND1H3BQB6 276 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SYT5O00445 386 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RFXANKO14593 260 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NPC1O15118 1278 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MID1O15344 667 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TGOLN2O43493 480 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 FADS1O60427 444 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ECI2O75521 394 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TBX18O95935 607 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 IFNA17P01571 189 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HOXB5P09067 269 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 EBLN1P0CF75 366 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CBSLP0DN79 551 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A4P12235 298 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RAC2P15153 192 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HOXA5P20719 270 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PRPS1L1P21108 318 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MST1P26927 711 aa6.65□□□□□ -1.34
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