RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FTCDNL1E5RQL4 147 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 M0QZQ0 153 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAP1BP61224 184 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAP1AP62834 184 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC6A19Q695T7 634 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TPRA1Q86W33 373 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GABRR1P24046 479 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAP2BP61225 183 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB33AQ14088 237 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NFATC4Q14934 902 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRR22Q8IZ63 422 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCRL1Q96LA6 429 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HHATLQ9HCP6 504 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OLAHQ9NV23 265 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM100Q9NV29 134 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAMTS4O75173 837 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP3CBP16298 524 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB5CP51148 216 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCRLAQ7L513 359 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACOT4Q8N9L9 421 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR7D2Q96RA2 312 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSTD3H0UI37 97 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H3BUI4 141 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LILRB5O75023 590 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MED6O75586 246 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCATP04180 440 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C5AR1P21730 350 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GABRA5P31644 462 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ETV5P41161 510 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HHEXQ03014 270 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLO1Q04760 184 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RETREG3Q86VR2 466 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WASH4PA8MWX3 477 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 F5H5K5 113 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JMJD7P0C870 316 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MMP12P39900 470 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LSMEM2Q8N112 164 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPATCH2Q9NW75 528 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PS29 197 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCR7P32248 378 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC6A8P48029 635 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CENPOQ9BU64 300 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NRAPQ86VF7 1730 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HTD2P86397 168 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSX2Q16385 188 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MICU1Q9BPX6 476 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACKR4Q9NPB9 350 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H3BML4 177 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTHP01270 115 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EDN1P05305 212 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBL4AP11441 157 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK3Q00526 305 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OPCMLQ14982 345 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYPL1Q16563 259 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NHSL2Q5HYW2 709 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C18orf63Q68DL7 685 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLTPQ9NZD2 209 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSBP1L1C9JCN9 74 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 P2RX6O15547 441 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERPINE2P07093 398 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SULF2Q8IWU5 870 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR56B4Q8NH76 319 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF128Q8TEB7 428 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DRGXA6NNA5 263 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD28O15084 1053 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FADS1O60427 444 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GJB3O75712 270 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DUSP7Q16829 419 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4M1Q8NGD0 313 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CASD1Q96PB1 797 aa16.06■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms