RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 COLCA2A8K830 154 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 MRASO14807 208 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 UBDO15205 165 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 AKAP3O75969 853 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 FGF19O95750 216 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 INHBAP08476 426 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 CSF3P09919 207 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 STAG3L2P0CL84 134 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SCGB1A1P11684 91 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 PEPDP12955 493 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 PGAM1P18669 254 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 TNFSF8P32971 234 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 GGT2P36268 569 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 IFNGR2P38484 337 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 MMP12P39900 470 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 CLCN3P51790 818 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 EMP2P54851 167 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-215ENST00000475319 TAS2R39P59534 338 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 LSM6P62312 80 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SELENOTP62341 195 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 CSNK1G2P78368 415 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC10A1Q14973 349 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ARL6IP1Q15041 203 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC9A3R2Q15599 337 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF284Q2VY69 593 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 PLA1AQ53H76 456 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 BEX5Q5H9J7 111 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 Q5PR19 223 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 LRRC38Q5VT99 294 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 TRIQKQ629K1 86 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 LCN8Q6JVE9 175 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 MOXD1Q6UVY6 613 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 EPGNQ6UW88 154 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-215ENST00000475319 CATSPERDQ86XM0 798 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF573Q86YE8 665 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 BAP18Q8IXM2 172 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 DAW1Q8N136 415 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 OR2M7Q8NG81 312 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-215ENST00000475319 EDAQ92838 391 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 TADA1Q96BN2 335 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 COQ8BQ96D53 544 aa5.55□□□□□ -1.52
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ECHDC1-215ENST00000475319 KAZALD1Q96I82 304 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 FCRL1Q96LA6 429 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 TAAR6Q96RI8 345 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF382Q96SR6 550 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 PHB2Q99623 299 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 PIGQQ9BRB3 760 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 DUSP21Q9H596 190 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 FKRPQ9H9S5 495 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 MIEF1Q9NQG6 463 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.525e-12■■■■■ 43.9
ECHDC1-215ENST00000475319 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 VNN3Q9NY84 501 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 Q9UFV3 132 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SMPXQ9UHP9 88 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 DKKL1Q9UK85 242 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 GABRQQ9UN88 632 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC7A11Q9UPY5 501 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ICKQ9UPZ9 632 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 KCPQ6ZWJ8 1503 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa5.55□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 MEIKINA0A087WXM9 373 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 PDXKO00764 312 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 GRM6O15303 877 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 TGOLN2O43493 480 aa5.54□□□□□ -1.52
ECHDC1-215ENST00000475319 PRAMEF10O60809 474 aa5.54□□□□□ -1.52
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