RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 APH1BQ8WW43 257 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 APH1AQ96BI3 265 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RBP7Q96R05 134 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF670Q9BS34 389 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ATP10DQ9P241 1426 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQY0 241 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 C9JVG2 144 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CNMDO75829 334 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LIPFP07098 398 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ADRB2P07550 413 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NMBP08949 121 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HSD17B1P14061 328 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ABOP16442 354 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 F2RP25116 425 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RFX2P48378 723 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PAX5Q02548 391 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MAMLD1Q13495 774 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MPEG1Q2M385 716 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF667Q5HYK9 610 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HACD2Q6Y1H2 254 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 C4orf32Q8N8J7 132 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CD244Q9BZW8 370 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM9BQ9NQ34 198 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GPR83Q9NYM4 423 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CACNG4Q9UBN1 327 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MED14O60244 1454 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF609O15014 1411 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CA12O43570 354 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR13C7P0DN81 318 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ITGB5P18084 799 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NTF3P20783 257 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CD200P41217 278 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MTPNP58546 118 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2V2Q15819 145 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SPIN4Q56A73 249 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 VITQ6UXI7 678 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZTK2 550 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR52J3Q8NH60 311 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM234Q8WY98 164 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TSSK3Q96PN8 268 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC18AA5D8T8 446 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CD8B2A6NJW9 211 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 XKRYO14609 159 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 STBD1O95210 358 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GGT1P19440 569 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GPR3P46089 330 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CDC20BQ86Y33 519 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR1J2Q8NGS2 313 aa5.25□□□□□ -1.57
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