RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 RRADP55042 308 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CXADRP78310 365 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CPZQ66K79 652 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SMOXQ9NWM0 555 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FAPQ12884 760 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR52W1Q6IF63 320 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OSTM1Q86WC4 334 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C1orf198Q9H425 327 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KCTD3Q9Y597 815 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ITGAMP11215 1152 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GMPRP36959 345 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MMP21Q8N119 569 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC43A2Q8N370 569 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SCAMP4Q969E2 229 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 MYOM1P52179 1685 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 C4orf47A7E2U8 309 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 K7EPK0 472 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 STC2O76061 302 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RGS11O94810 467 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 EVI2BP34910 448 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 VIPR2P41587 438 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TNFRSF4P43489 277 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 NR0B2Q15466 257 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.28□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FGGYQ96C11 551 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GON7Q9BXV9 100 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C17orf105B2RV13 164 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SURF4O15260 269 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ADAM23O75077 832 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PRKAR1BP31321 381 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CA5AP35218 305 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ERVK-25P63136 954 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PLA2G7Q13093 441 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF266Q14584 549 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PEBP4Q96S96 227 aa6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 OR7A17O14581 309 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DDAH2O95865 285 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 HOXC13P31276 330 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 STEAP3Q658P3 488 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 LACC1Q8IV20 430 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CPOQ8IVL8 374 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR7G3Q8NG95 312 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.27□□□□□ -1.41
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