RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 RNF170Q96K19 258 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 UCN2Q96RP3 112 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF382Q96SR6 550 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 PIP5K1AQ99755 562 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 LDAHQ9H6V9 325 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 DLL4Q9NR61 685 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 Q9UFV3 132 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 CD300AQ9UGN4 299 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 OR2W5A6NFC9 320 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 C17orf105B2RV13 164 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 GTF2H2Q13888 395 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 AARDQ4LEZ3 155 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 DGAT2Q96PD7 388 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 MS4A8Q9BY19 250 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 TIGARQ9NQ88 270 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 ISPDA4D126 451 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 CENPXA8MT69 81 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 A8MUA0 341 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 ACTL6AO96019 429 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 HPNP05981 417 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 MTHFD2P13995 350 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 IL7RP16871 459 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 ATP4BP51164 291 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRR-204ENST00000440835 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 SMPDL3BQ92485 455 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 RGMAQ96B86 450 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 DACH2Q96NX9 599 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 AICDAQ9GZX7 198 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 DSN1Q9H410 356 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 MEAF6Q9HAF1 191 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 PCTPQ9UKL6 214 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 BAG5Q9UL15 447 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 AURKCQ9UQB9 309 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRR-204ENST00000440835 AP3M1Q9Y2T2 418 aa5.5□□□□□ -1.53
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