RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440288.6

SH3BGR-206, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

TSL 5

Gene SH3BGR, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-206	ENST00000440288	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	MECR	Q9BV79	373 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288		A0A1W2PNR3	127 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	RNF223	E7ERA6	249 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	GPR171	O14626	319 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	SPAG7	O75391	227 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	LYZL6	O75951	148 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	NUDT17	P0C025	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	TFPI	P10646	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	CLDN8	P56748	225 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	HBA1	P69905	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	EMX2	Q04743	252 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	FAP	Q12884	760 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	SYT14P1	Q58G82	188 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	DPY30	Q9C005	99 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	OVOL3	O00110	214 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	DNPH1	O43598	174 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	CRLF1	O75462	422 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	NTN1	O95631	604 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	G6PD	P11413	515 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	UQCRB	P14927	111 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	CDKN1A	P38936	164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	DIO1	P49895	249 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	CDH11	P55287	796 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	C21orf58	P58505	322 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	GNA13	Q14344	377 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ZNF141	Q15928	474 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ARID1A	O14497	2285 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	ABCD4	O14678	606 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	EFNA2	O43921	213 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	SOD3	P08294	240 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	DANCR	P0C864	163 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	MYZAP	P0CAP1	466 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	NID1	P14543	1247 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	PTAFR	P25105	342 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	MAGEA8	P43361	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	HTR3A	P46098	478 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	SESN3	P58005	492 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	DSCR9	P59020	149 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	SKP2	Q13309	424 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	PDK3	Q15120	406 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SH3BGR-206	ENST00000440288	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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