RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RY12Q9H244 342 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL15Q9NXU5 204 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MBD2Q9UBB5 411 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087WV62 115 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GV90 55 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01553A4QN01 128 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 MTNR1BP49286 362 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 HBA1P69905 142 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FRG2Q64ET8 278 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FDX2Q6P4F2 183 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP206Q8IYR0 622 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2C3Q8N628 320 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 NR4A3Q92570 626 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 IGSF8Q969P0 613 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FRG2BQ96QU4 278 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC32A1Q9H598 525 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF576Q9H609 170 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KCND3Q9UK17 655 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 UBL3O95164 117 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHX1P07099 455 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF35P13682 527 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 DGKAP23743 735 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A11P48066 632 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PGDP52209 483 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GUCD1Q96NT3 240 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP3K3Q99759 626 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MFFQ9GZY8 342 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 FAAHO00519 579 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 AQP8O94778 261 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 OPN1MWP04001 364 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 NFYBP25208 207 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-203ENST00000439720 NPBWR1P48145 328 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CCR8P51685 355 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CCR9P51686 369 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB5BP61020 215 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.8□□□□□ -1.16
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