RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 DYRK1AQ13627 763 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 DOC2AQ14183 400 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 FAM209BQ5JX69 171 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 FAIM2Q9BWQ8 316 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 DNTTIP1Q9H147 329 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 FN3KQ9H479 309 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 WDR26Q9H7D7 661 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM202A6NGA9 273 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 GPR37L1O60883 481 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SH3BGRLO75368 114 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 UBL3O95164 117 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 GABRA1P14867 456 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SDHBP21912 280 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 MMP11P24347 488 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 PRLHRP49683 370 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 RAP2BP61225 183 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 DEFA5Q01523 94 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 OR52N1Q8NH53 320 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 NSMAFQ92636 917 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 DMRTA2Q96SC8 542 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 MGAT4CQ9UBM8 478 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF33A8MVX0 844 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SUSD5O60279 629 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 WNT1P04628 370 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 PFN3P60673 137 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ASB11Q8WXH4 323 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 FOXJ1Q92949 421 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 POM121BA6NF01 834 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 YKT6O15498 198 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 RNF13O43567 381 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF217O75362 1048 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 PPP3CBP16298 524 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 HAAOP46952 286 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 CXCL12P48061 93 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 CLDN2P57739 230 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 GPR156Q8NFN8 814 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF649Q9BS31 505 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 GPR174Q9BXC1 333 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ABCG4Q9H172 646 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 CTSFQ9UBX1 484 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 C5orf58C9J3I9 102 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 H0Y8X5 98 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 H0YIV9 168 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 HPP00738 406 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 RAB13P51153 203 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 DMWDQ09019 674 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA0895LQ68EN5 471 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 TMUB2Q71RG4 321 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 BMFQ96LC9 184 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ORAI3Q9BRQ5 295 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 BIN3Q9NQY0 253 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 NINQ8N4C6 2090 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1B0GUH1 482 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 GSAPA4D1B5 854 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 LRRN3E7EW58 273 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms