RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 CCL19Q99731 98 aa24.23■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 NAV3Q8IVL0 2385 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 E9PBE3 544 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 H6PDO95479 791 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 AGR2O95994 175 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 YES1P07947 543 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 SLC7A1P30825 629 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 PGM1P36871 562 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 SESN3P58005 492 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 DPY19L1Q2PZI1 675 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 SLC43A2Q8N370 569 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 FAM71CQ8NEG0 241 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 ST8SIA1Q92185 356 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 ZG16BQ96DA0 208 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 SMR3AQ99954 134 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 SAP130Q9H0E3 1048 aa24.22■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 SDHDO14521 159 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 S100A3P33764 101 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 NME5P56597 212 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 WDR4P57081 412 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 UFM1P61960 85 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 Q5PR19 223 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 ATAD3BQ5T9A4 648 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 C3orf33Q6P1S2 294 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 FRRS1Q6ZNA5 592 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 WFDC8Q8IUA0 241 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 P3H2Q8IVL5 708 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 ANKRD42Q8N9B4 389 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 S100PBPQ96BU1 408 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 ROPN1LQ96C74 230 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 C18orf12Q96KH6 178 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 CCDC115Q96NT0 180 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 PSD2Q9BQI7 771 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 SLC35A5Q9BS91 424 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 BCO1Q9HAY6 547 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 POLE3Q9NRF9 147 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 WDR45Q9Y484 360 aa24.21■■□□□ 1.47
LMO1-202ENST00000428101 ARHGEF9O43307 516 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 PLAUP00749 431 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 IL12AP29459 219 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 TSC22D1Q15714 1073 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 CROCCP2Q86T23 111 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 OIT3Q8WWZ8 545 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 IGFBPL1Q8WX77 278 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 PLPPR2Q96GM1 343 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 OR5B2Q96R09 309 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 TMEM204Q9BSN7 226 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 HDHD5Q9BXW7 423 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 ACER3Q9NUN7 267 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 AIG1Q9NVV5 245 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 BTNL2Q9UIR0 455 aa24.2■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 ZNF814B7Z6K7 855 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 PGCP20142 388 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 NR1H2P55055 460 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 SFRP5Q5T4F7 317 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 HHATQ5VTY9 493 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 BIVMQ86UB2 503 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 ZNF619Q8N2I2 560 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 STEAP2Q8NFT2 490 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 ARL8AQ96BM9 186 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa24.19■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 USF3Q68DE3 2245 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 C9JVG2 144 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 HMGN4O00479 90 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 CYTIPO60759 359 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 INHBBP09529 407 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 KHKP50053 298 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 PLAURQ03405 335 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 MERTKQ12866 999 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 HMGN2P46Q86SG4 172 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 TMEM234Q8WY98 164 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 KLHL9Q9P2J3 617 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 TMEM120BA0PK00 339 aa24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 SNNO75324 88 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 ADAP00813 363 aa24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 CHRNEQ04844 493 aa24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 PRSS57Q6UWY2 283 aa24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 SPATA19Q7Z5L4 167 aa24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 RNF130Q86XS8 419 aa24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 PERPQ96FX8 193 aa24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 INPP5KQ9BT40 448 aa24.17■■□□□ 1.46
LMO1-202ENST00000428101 CCDC106Q9BWC9 280 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms