RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	SGCD	Q92629	289 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	NKD1	Q969G9	470 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	AKAP13	Q12802	2813 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	ZAR1L	A6NP61	321 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	CLPTM1	O96005	669 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	SMIM18	P0DKX4	95 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	CDC42	P60953	191 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM156	Q8N614	296 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	AMBN	Q9NP70	447 aa		10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
RAD9B-204	ENST00000409300	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	FPR3	P25089	353 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	RPS6KA3	P51812	740 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ATP1A4	Q13733	1029 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	LYPD8	Q6UX82	237 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	OR51A7	Q8NH64	312 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ASB15	Q8WXK1	588 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	HGD	Q93099	445 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	MPP4	Q96JB8	637 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300		A0A087WUJ7	227 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	DPPA5	A6NC42	116 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	LRRN3	E7EW58	273 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC1A7	O00341	560 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	WISP1	O95388	367 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	FBXO45	P0C2W1	286 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ICAM2	P13598	275 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	NAGA	P17050	411 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	CRHBP	P24387	322 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TACR3	P29371	465 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	GIPR	P48546	466 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	PIGF	Q07326	219 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	CBFB	Q13951	182 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	GINS1	Q14691	196 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	CASP12	Q6UXS9	341 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC103	Q8IW40	242 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	OR5W2	Q8NH69	310 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	MED11	Q9P086	117 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ENO4	A6NNW6	628 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300		E9PQ18	207 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	CH25H	O95992	272 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	HP	P00738	406 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC1A3	P43003	542 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	P2RX1	P51575	399 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	NUP107	P57740	925 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	NHLH1	Q02575	133 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	PRKCD	Q05655	676 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	NTRK2	Q16620	822 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	APH1B	Q8WW43	257 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TTC9	Q92623	222 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	VDAC3	Q9Y277	283 aa		10.26	□□□□□ -0.77

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