RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397149.3

SMU1-201, Transcript of SMU1, DNA replication regulator and spliceosomal factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMU1, Length 7,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1-201ENST00000397149 LIPT1Q9Y234 373 aa11.61□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 MED14O60244 1454 aa11.61□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CDK2AP1O14519 115 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 RD3LP0DJH9 198 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 FCGR2AP12318 317 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CSN1S1P47710 185 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 SORDQ00796 357 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 OR6C76A6NM76 312 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 G3V3Y1 287 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 M0R3H8 397 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 PRAMEF2O60811 474 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 SULT1C4O75897 302 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CNR2P34972 360 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 HLCSP50747 726 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 EMP2P54851 167 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 TAS2R38P59533 333 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ERV3-1Q14264 604 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ACKR1Q16570 336 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 HACD4Q5VWC8 232 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CLECL1Q8IZS7 167 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 SLC35G3Q8N808 338 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 EBF1Q9UH73 591 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 INSL5Q9Y5Q6 135 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 NSA2O95478 260 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ONECUT2O95948 504 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ZNF546Q86UE3 836 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 HSD17B14Q9BPX1 270 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 PGGT1BP53609 377 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ATP1B3P54709 279 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 THNSL2Q86YJ6 484 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 GPR22Q99680 433 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 C12orf49Q9H741 205 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CYTIPO60759 359 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 NPY1RP25929 384 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 AMTP48728 403 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 RAC1P63000 192 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CATR1Q13166 79 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 LDB3O75112 727 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CD1BP29016 333 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 TM7SF3Q9NS93 570 aa11.6□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ANTXRLA6NF34 631 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 SMIM17P0DL12 118 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 FUT1P19526 365 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 MS4A13Q5J8X5 152 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 SSX9Q7RTT3 188 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CPOQ8IVL8 374 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 GPR148Q8TDV2 347 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 DTD1Q8TEA8 209 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 GABRQQ9UN88 632 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 HPGDSO60760 199 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 RFPL3O75679 317 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 EPOP01588 193 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CCL11P51671 97 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 GLO1Q04760 184 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 GLB1L2Q8IW92 636 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 OR9Q2Q8NGE9 314 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 SRRQ9GZT4 340 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 TNFRSF19Q9NS68 423 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 RNF212BA8MTL3 300 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 CXCR4P61073 352 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 EPGNQ6UW88 154 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 HUS1BQ8NHY5 278 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 HEBP1Q9NRV9 189 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 FBXL2Q9UKC9 423 aa11.59□□□□□ -0.55
SMU1-201ENST00000397149 A0A087WZY1 265 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms