RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 NUF2Q9BZD4 464 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 DPY30Q9C005 99 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 CENPHQ9H3R5 247 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 PRSS50Q9UI38 385 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 ANKRD28O15084 1053 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 CSTAP01040 98 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 YES1P07947 543 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 SLC1A6P48664 564 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 SESN3P58005 492 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 TAB1Q15750 504 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 MREGQ8N565 214 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 ZG16BQ96DA0 208 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 TEX37Q96LM6 180 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 PSD2Q9BQI7 771 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 LAT2Q9GZY6 243 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 PNPOQ9NVS9 261 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 CLDN24A6NM45 220 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 HS3ST1O14792 307 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 CLOCKO15516 846 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 KIAA0513O60268 411 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 HEXAP06865 529 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 MYZAPP0CAP1 466 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 IL32P24001 234 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 NR1H2P55055 460 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 RAC3P60763 192 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 PLAURQ03405 335 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 MERTKQ12866 999 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 GSX2Q9BZM3 304 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 FANCFQ9NPI8 374 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-208ENST00000392449 DUXAA6NLW8 204 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 BIRC5O15392 142 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 DNAJA2O60884 412 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ADAM11O75078 769 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 LYZL6O75951 148 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SOX30O94993 753 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 FESP07332 822 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 RYKP34925 604 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PGM1P36871 562 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SMU1Q2TAY7 513 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 OR10A4Q9H209 315 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 BCO1Q9HAY6 547 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 WDR45Q9Y484 360 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 AK1P00568 194 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 UQCRC2P22695 453 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 DIO1P49895 249 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CASP8Q14790 479 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SAXO2Q658L1 398 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SLC43A2Q8N370 569 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF611Q8N823 705 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 TESCQ96BS2 214 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ROPN1LQ96C74 230 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ZIM3Q96PE6 472 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 EXD2Q9NVH0 621 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CADP27708 2225 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 TM9SF1O15321 606 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms