RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 NICN1Q9BSH3 213 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-202ENST00000380828 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-202ENST00000380828 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-202ENST00000380828 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-202ENST00000380828 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-202ENST00000380828 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0U1RQF3 1178 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf78A6NCI8 922 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BN98 237 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC19A2O60779 497 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GLCEO94923 617 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GABARAPO95166 117 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 S1PR4O95977 384 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CFIP05156 583 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SHC1P29353 583 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 VEGFBP49765 207 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BCAT1P54687 386 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAG2P55895 527 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NR6A1Q15406 480 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TCTN2Q96GX1 697 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FCRL5Q96RD9 977 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SORT1Q99523 831 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BOCQ9BWV1 1114 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 IL21RQ9HBE5 538 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MED9Q9NWA0 146 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CPED1A4D0V7 1026 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 E5RGE8 158 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK8O60259 260 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AQP8O94778 261 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 INHAP05111 366 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PNLIPRP1P54315 467 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DAOAP59103 153 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ENPP2Q13822 863 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TGIF1Q15583 401 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4C6Q8NH72 309 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF125Q96EQ8 232 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 Q96MT0 163 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RDH12Q96NR8 316 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF121Q9H920 327 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PADI1Q9ULC6 663 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PLXNB2O15031 1838 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DISC1C4P0D8 188 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AP4M1O00189 453 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ADORA2AP29274 412 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SSTR1P30872 391 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A6P31641 620 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGEA6P43360 314 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAP1BP61224 184 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ASCL4Q6XD76 172 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MAVSQ7Z434 540 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BEST4Q8NFU0 473 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10A6Q8NH74 314 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CERS2Q96G23 380 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PRRC1Q96M27 445 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5B2Q96R09 309 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ACOX2Q99424 681 aa6.33□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADI1Q9BV57 179 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SGPP1Q9BX95 441 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SIX2Q9NPC8 291 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR83Q9NYM4 423 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PSG11Q9UQ72 335 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AQP7P3A6NL99 342 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAMP3O60896 148 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LALBAP00709 142 aa6.32□□□□□ -1.4
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