RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 MCEMP1Q8IX19 187 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CMIPQ8IY22 773 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 NFKBIDQ8NI38 313 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ST8SIA1Q92185 356 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ZFP3Q96NJ6 502 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 SFXN3Q9BWM7 321 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ACER3Q9NUN7 267 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 JKAMPQ9P055 326 aa24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 GPX2P18283 190 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 MTPNP58546 118 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 SIRPAP78324 504 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 SELENBP1Q13228 472 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 NFYCQ13952 458 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 LIN52Q52LA3 116 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CLIP4Q8N3C7 705 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF563Q8TA94 476 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 TSPEARQ8WU66 669 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CGREF1Q99674 301 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 STOML1Q9UBI4 398 aa24.19■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PNR3 127 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CDHR4A6H8M9 788 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PGM3O95394 542 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 GKN3PP0CG01 181 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PPIBP23284 216 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 UQCRC1P31930 480 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 SEC24CP53992 1094 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 GYS2P54840 703 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 MERTKQ12866 999 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 LUZP2Q86TE4 346 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PMM1Q92871 262 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 OSTF1Q92882 214 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD27Q96NW4 1050 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC106Q9BWC9 280 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 BCL2L10Q9HD36 194 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CTPS2Q9NRF8 586 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CLEC4AQ9UMR7 237 aa24.18■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0G2JPF8 293 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 IDH2P48735 452 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 EPS8Q12929 822 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 GUSBP1Q15486 140 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ADRM1Q16186 407 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 BBS10Q8TAM1 723 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM234Q8WY98 164 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ROBO4Q8WZ75 1007 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 SLC39A3Q9BRY0 314 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ARMCX1Q9P291 453 aa24.17■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM247A6NEH6 219 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PRG2P13727 222 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 KLK2P20151 261 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CDK6Q00534 326 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 GNA13Q14344 377 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 OR2A2Q6IF42 318 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 C3orf33Q6P1S2 294 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 BTLAQ7Z6A9 289 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 COMTD1Q86VU5 262 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 SNX32Q86XE0 403 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 STARD4Q96DR4 205 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 DOCK7Q96N67 2140 aa24.16■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 EVPLLA8MZ36 301 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 FXYD1O00168 92 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 SYT5O00445 386 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 THBS1P07996 1170 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CARD18P57730 90 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 RNF220Q5VTB9 566 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 REP15Q6BDI9 236 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PTOV1Q86YD1 416 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJA3Q96EY1 480 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PRRG4Q9BZD6 226 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM38AQ9H6F2 299 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 PACSIN3Q9UKS6 424 aa24.15■■□□□ 1.46
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP73A6NFT4 308 aa24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 C5orf58C9J3I9 102 aa24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 FRS3O43559 492 aa24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 SYNGR4O95473 234 aa24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 FCGR2AP12318 317 aa24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 AQP1P29972 269 aa24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 SCARB2Q14108 478 aa24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF311Q5JNZ3 666 aa24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 PDSS1Q5T2R2 415 aa24.14■■□□□ 1.45
TPGS1-201ENST00000359315 GRINAQ7Z429 371 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms