RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 RTL4Q6ZR62 310 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.9□□□□□ -0.02
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HPS1-202ENST00000338546 MISPQ8IVT2 679 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 C3orf49Q96BT1 292 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SAMD8Q96LT4 415 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.9□□□□□ -0.02
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HPS1-202ENST00000338546 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.9□□□□□ -0.02
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HPS1-202ENST00000338546 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 BHLHE40O14503 412 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SLC22A1O15245 554 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ICOSLGO75144 302 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 LCKP06239 509 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ADORA3P0DMS8 318 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
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HPS1-202ENST00000338546 CD226Q15762 336 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TIGD6Q17RP2 521 aa14.9□□□□□ -0.02
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HPS1-202ENST00000338546 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.9□□□□□ -0.02
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HPS1-202ENST00000338546 CMKLR1Q99788 373 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 CTRCQ99895 268 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
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HPS1-202ENST00000338546 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.89□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.89□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 NFATC3Q12968 1075 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CTF1Q16619 201 aa14.89□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 PEX19P40855 299 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 SLC1A3P43003 542 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 FXYD6P3P58550 94 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 SLC26A5P58743 744 aa14.88□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.88□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 TCEAL3Q969E4 200 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 MND1Q9BWT6 205 aa14.88□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 ZFAND5O76080 213 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 PTHP01270 115 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 CD36P16671 472 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 HTR1FP30939 366 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 MTNR1AP48039 350 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 PRR22Q8IZ63 422 aa14.87□□□□□ -0.03
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