RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 A0A087WUJ7 227 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 IRGMA1A4Y4 181 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 BHLHE40O14503 412 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF264O43296 627 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 PTP4A3O75365 173 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 HSMCR30P0CW71 290 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 BMP7P18075 431 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 GADD45AP24522 165 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 GRK6P43250 576 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CCR4P51679 360 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CDH11P55287 796 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 DOC2BQ14184 412 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 IL11RAQ14626 422 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 MED22Q15528 200 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM44Q2T9K0 475 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 KLHL22Q53GT1 634 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SLCO6A1Q86UG4 719 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 BMPERQ8N8U9 685 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 AGBL5Q8NDL9 886 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 NDNFQ8TB73 568 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SGTBQ96EQ0 304 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 IFT27Q9BW83 186 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ICAM5Q9UMF0 924 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ERGIC3Q9Y282 383 aa11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 GDF9O60383 454 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CSO75390 466 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF883P0CG24 379 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ABCD3P28288 659 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 VBP1P61758 197 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 NCS1P62166 190 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 RNF4P78317 190 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CBLN3Q6UW01 205 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 LNX2Q8N448 690 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 OR51A7Q8NH64 312 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SPSB2Q99619 263 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 MND1Q9BWT6 205 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 RTN4RQ9BZR6 473 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 LAT2Q9GZY6 243 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 MCCC2Q9HCC0 563 aa11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 MEN1O00255 615 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 APOL3O95236 402 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF28P17035 718 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 MTNR1AP48039 350 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 PNLIPRP2P54317 469 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 RAB40BQ12829 278 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 TSTQ16762 297 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 PAQR6Q6TCH4 344 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 OAFQ86UD1 273 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 NANOGP1Q8N7R0 232 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 BBS1Q8NFJ9 593 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 RFKQ969G6 155 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 MGLLQ99685 303 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 CRB3Q9BUF7 120 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PQD3 144 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 SOCS6O14544 535 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 MYL12BO14950 172 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 AIREO43918 545 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 CDK4P11802 303 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ACP1P24666 158 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 AVPR2P30518 371 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 SLC6A6P31641 620 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 RGS6P49758 472 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 PSPHP78330 225 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF117Q03924 483 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 FHL1Q13642 323 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ELOA3BQ3SY89 546 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 MARCH3Q86UD3 253 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 CPOQ8IVL8 374 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ELOA3Q8NG57 546 aa11.39□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 TP53INP1Q96A56 240 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms