RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 CLUP10909 449 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TMED10P49755 219 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 BTG2P78543 158 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 STX4Q12846 297 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ERV3-1Q14264 604 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TAB1Q15750 504 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CT45A2Q5DJT8 189 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 KIRREL2Q6UWL6 708 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SYT13Q7L8C5 426 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 UBQLNLQ8IYU4 475 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF576Q9H609 170 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 NPAP1Q9NZP6 1156 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXL4Q9UKA2 621 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 HEATR5AQ86XA9 2040 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 BLACEA4D250 179 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 OR2W5A6NFC9 320 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF2O60811 474 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CHRNB1P11230 501 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 OR10H4Q8NGA5 316 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 OR6C4Q8NGE1 309 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 DAPL1A0PJW8 107 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RIIAD1A6NNX1 92 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CLPSP04118 112 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SBK2P0C263 348 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 OR2B6P58173 313 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SCN1BQ07699 218 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 OAFQ86UD1 273 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 NR2C2APQ86WQ0 139 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC43A2Q8N370 569 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CYB561A3Q8NBI2 242 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TCTN2Q96GX1 697 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ART5Q96L15 291 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 OR51V1Q9H2C8 321 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 COMMD3Q9UBI1 195 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 LILRA5A6NI73 299 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 HPGDSO60760 199 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TMCC2O75069 709 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PROS1P07225 676 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF3P17036 446 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 HTR3AP46098 478 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SKP1P63208 163 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF85Q03923 595 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 FUT7Q11130 342 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CNIH2Q6PI25 160 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 GATAD2AQ86YP4 633 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 C16orf52Q8NHV5 167 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 DGAT2Q96PD7 388 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 UCK1Q9HA47 277 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM36Q9NQ86 728 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 HAO2Q9NYQ3 351 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 E9PI62 339 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF749O43361 778 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CSF2P04141 144 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PEPDP12955 493 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 NME1P15531 152 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 MAOAP21397 527 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC6A6P31641 620 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP12AP54707 1039 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNJ8Q15842 424 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 NNATQ16517 81 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFAF6Q330K2 333 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF550Q7Z398 422 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF687Q8N1G0 1237 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4C6Q8NH72 309 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM174AQ8TBP5 190 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 TPSD1Q9BZJ3 242 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 Q9N2J8 555 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 SERTAD3Q9UJW9 196 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ERVK-19Q9WJR5 959 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDH15Q96QU1 1955 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1W2PR77 199 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 HLA-DQB1P01920 261 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 HK1P19367 917 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 MTNR1BP49286 362 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS7P62081 194 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 GAS6Q14393 721 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 ULK3Q6PHR2 472 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 RTL4Q6ZR62 310 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 LRIT1Q9P2V4 623 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNQ1-202ENST00000335475 CHRNA9Q9UGM1 479 aa19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms