RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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PDGFB-201ENST00000331163 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 OR6A2O95222 327 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 GABARAPL2P60520 117 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 MXD1Q05195 221 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 SLC39A7Q92504 469 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 TEX12Q9BXU0 123 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 GPAT4Q86UL3 456 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 SLC41A3Q96GZ6 507 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 SEC14L5O43304 696 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 STSP08842 583 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 KCNJ5P48544 419 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 SLC35A2P78381 396 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 MANEAQ5SRI9 462 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 BCORP1Q8N888 145 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.62□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 YKT6O15498 198 aa14.62□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 SLC15A1P46059 708 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 PCDH1Q08174 1060 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 FOXC1Q12948 553 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 NPRL3Q12980 569 aa14.62□□□□□ -0.07
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PDGFB-201ENST00000331163 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 OMA1Q96E52 524 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 YIPF6Q96EC8 236 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 GPR83Q9NYM4 423 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 H0YIG0 161 aa14.62□□□□□ -0.07
PDGFB-201ENST00000331163 RFPL3O75679 317 aa14.62□□□□□ -0.07
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