RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 G3V3Q6 166 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZP1P60852 638 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZIC1Q15915 447 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 RRM2BQ7LG56 351 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 OR5M3Q8NGP4 307 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 CHIAQ9BZP6 476 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PCBD2Q9H0N5 130 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM168Q9H0V1 697 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM5Q9Y2B1 443 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PRSS38A1L453 326 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 FCMRO60667 390 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 UBXN7O94888 489 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ASGR2P07307 311 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SULT1A3P0DMM9 295 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SULT1A4P0DMN0 295 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 LCN1P31025 176 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PITPNBP48739 271 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 TSPAN5P62079 268 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 AGERQ15109 404 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 GSG1Q2KHT4 349 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SLC36A2Q495M3 483 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 TFAP2EQ6VUC0 442 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SFXN2Q96NB2 322 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 BRD7Q9NPI1 651 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 OR6C2Q9NZP2 312 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PTGFRNQ9P2B2 879 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 A0A1B0GVI7 797 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SLC2A10O95528 541 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 HPXP02790 462 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 GNSP15586 552 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 DRD5P21918 477 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF542PQ5EBM4 170 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ENTPD8Q5MY95 495 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF527Q8NB42 609 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF485Q8NCK3 441 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PTP4A1Q93096 173 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 DDOQ99489 341 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 TBX5Q99593 518 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 CPNE7Q9UBL6 633 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa18■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PRR19A6NJB7 356 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 FAM183AA6NL82 134 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 HOXB2P14652 356 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 HSD17B2P37059 387 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 OPCMLQ14982 345 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 NHLRC3Q5JS37 347 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 MTFR2Q6P444 385 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 CD300LDQ6UXZ3 194 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 VN1R4Q7Z5H5 301 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PRRC1Q96M27 445 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ISYNA1Q9NPH2 558 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 OBP2AQ9NY56 170 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 KIF25Q9UIL4 384 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 BAIAP2Q9UQB8 552 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 FAM111BQ6SJ93 734 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 NLRC3Q7RTR2 1065 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PRSS41Q7RTY9 318 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SIAH3Q8IW03 269 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 TIMM29Q9BSF4 260 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 CHST2Q9Y4C5 530 aa17.99■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 IRGMA1A4Y4 181 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 CASC3O15234 703 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 P2RX6O15547 441 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 GSTM3P21266 225 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 GPR4P46093 362 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 VASNQ6EMK4 673 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 TOMM5Q8N4H5 51 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 KLHL36Q8N4N3 616 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 OR10G6Q8NH81 332 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 LCN9Q8WX39 176 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 SESN1Q9Y6P5 492 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 H2AFB2P0C5Z0 115 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 PVRP15151 417 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms