RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 SMPDL3BQ92485 455 aa7.56□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.56□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 RNF122Q9H9V4 155 aa7.56□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ACER3Q9NUN7 267 aa7.56□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.56□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 EVPLLA8MZ36 301 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CXCL13O43927 109 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 AQP8O94778 261 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 SHC1P29353 583 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 FOXF1Q12946 379 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 GNA13Q14344 377 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 GUSBP1Q15486 140 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ADRM1Q16186 407 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 PDSS1Q5T2R2 415 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 OR2A2Q6IF42 318 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 MAL2Q969L2 176 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 STARD4Q96DR4 205 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 TMEM19Q96HH6 336 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 KLHL15Q96M94 604 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 A4GALTQ9NPC4 353 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 SAR1AQ9NR31 198 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 MRGBPQ9NV56 204 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 A0A1W2PNV4 684 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CDHR4A6H8M9 788 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 TMEM247A6NEH6 219 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 A8MXE2 369 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 FAAHO00519 579 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 FBP2O00757 339 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 TNFSF11O14788 317 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 PGM3O95394 542 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 BCHEP06276 602 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 THBS1P07996 1170 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 RYKP34925 604 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 SFTPDP35247 375 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 SLC6A8P48029 635 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 IDH2P48735 452 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ASCL1P50553 236 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CCR4P51679 360 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 KLF10Q13118 480 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 HBMQ6B0K9 141 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 VRK2Q86Y07 508 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 C14orf79Q96F83 325 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ADAM19Q9H013 955 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 RLIMQ9NVW2 624 aa7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 GJE1A6NN92 205 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 MSTNO14793 375 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ANGPT2O15123 496 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 CGAP01215 116 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ARAFP10398 606 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ETS2P15036 469 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 RAC3P60763 192 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 MERTKQ12866 999 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 SELENBP1Q13228 472 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 REEP3Q6NUK4 255 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.54□□□□□ -1.2
PPARG-201ENST00000287820 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.54□□□□□ -1.2
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