RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 LYSMD1Q96S90 227 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 MFFQ9GZY8 342 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SURF4O15260 269 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 OR10H2O60403 315 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SORDQ00796 357 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ASB6Q9NWX5 421 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.24□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 GMDSO60547 372 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 PRNPP04156 253 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TBXA2RP21731 343 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 LIMS1P48059 325 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TDGQ13569 410 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 GLRX5Q86SX6 157 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 OR52N1Q8NH53 320 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 DUXAA6NLW8 204 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZNF806P0C7X5 589 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZNF234Q14588 700 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TMEM239Q8WW34 195 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TET1Q8NFU7 2136 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 PTPRDP23468 1912 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 RBBP9O75884 186 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ACRP10323 421 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZNF35P13682 527 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ATF1P18846 271 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 HOXC8P31273 242 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TM4SF4P48230 202 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TAS2R43P59537 309 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 RAB12Q6IQ22 244 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 Q6ZTK2 550 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 PAQR7Q86WK9 346 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 COMMD2Q86X83 199 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 OR2T4Q8NH00 348 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 MPC2O95563 127 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CTGFP29279 349 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CDC42EP2O14613 210 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SHOXO15266 292 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ITGA3P26006 1051 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 IRS1P35568 1242 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SGCGQ13326 291 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 PDE7AQ13946 482 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CLLU1Q5K131 121 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ELOA3Q8NG57 546 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 LMLNQ96KR4 655 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 NOX4Q9NPH5 578 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 IFT46Q9NQC8 304 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CBLCQ9ULV8 474 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 AIFM1O95831 613 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 VAMP1P23763 118 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 DCTDP32321 178 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 DUSP6Q16828 381 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 RBP7Q96R05 134 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TEAD3Q99594 435 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 DPP7Q9UHL4 492 aa14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms