RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 EIPR1Q53HC9 387 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 MED20Q9H944 212 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 A0A0B4J293 547 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 CDHR4A6H8M9 788 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 IDH3BO43837 385 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 NKX2-2O95096 273 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 IGKV1D-16P01601 117 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 IFNGR2P38484 337 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 CFHR1Q03591 330 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 HSDL2Q6YN16 418 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 MRGPREQ86SM8 312 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 NACC2Q96BF6 587 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SURF4O15260 269 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ARL4DP49703 201 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 OR1Q1Q15612 314 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 DECR1Q16698 335 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 DDI2Q5TDH0 399 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 XKRXQ6PP77 449 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 DTX3Q8N9I9 347 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SAMD8Q96LT4 415 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 TBX5Q99593 518 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 OR2B3O76000 313 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 OR5F1O95221 314 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 KIR2DL3P43628 341 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 PLAURQ03405 335 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 NR4A3Q92570 626 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 A0A1W2PPC1 479 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ATP6V1E1P36543 226 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 TCTE1Q5JU00 501 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 CPOQ8IVL8 374 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 PFN4Q8NHR9 129 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 GRHL3Q8TE85 626 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ZNF649Q9BS31 505 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 A8MUA0 341 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 B4DXG7 233 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 GABRA5P31644 462 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ASAH1Q13510 395 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 GRM7Q14831 915 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 VASNQ6EMK4 673 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 CNIH2Q6PI25 160 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 KLBQ86Z14 1044 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 VSTM2LQ96N03 204 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 SLC22A4Q9H015 551 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GINS2-201ENST00000253462 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.1 ms