RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 ST3GAL2Q16842 350 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 AMZ1Q400G9 498 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4N4Q8N0Y3 316 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 MED31Q9Y3C7 131 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 OGG1O15527 345 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 STX11O75558 287 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 CLUP10909 449 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 PYCR1P32322 319 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 POU4F2Q12837 409 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 CRMP1Q14194 572 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 IDO2Q6ZQW0 420 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 USP53Q70EK8 1073 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH24Q86UP0 819 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTR6Q9GZN1 396 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SATB2Q9UPW6 733 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 MEN1O00255 615 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 LAMP2P13473 410 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 CAMK1Q14012 370 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 DCST2Q5T1A1 773 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 FHL5Q5TD97 284 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SSX6Q7RTT6 188 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 OR13C5Q8NGS8 318 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4C6Q8NH72 309 aa20.47■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF3P17036 446 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 CCR6P51684 374 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 FCRLBQ6BAA4 426 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 OR8H3Q8N146 312 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX11GQ96HA9 241 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFP3Q96NJ6 502 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 NPTNQ9Y639 398 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD61A6NGH8 418 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5EP21589 574 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 HSF2Q03933 536 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4N5Q8IXE1 308 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 OR56B4Q8NH76 319 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 GIMAP1Q8WWP7 306 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 MS4A3Q96HJ5 214 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 RADILQ96JH8 1075 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 PRDM9Q9NQV7 894 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 DLL4Q9NR61 685 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 EMC3Q9P0I2 261 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNN3Q9UGI6 736 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL4Q9UKA2 621 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA2Q9UM82 520 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 B8ZZF3 427 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM10L1P0DMW3 83 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR139Q6DWJ6 353 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 CACUL1Q86Y37 369 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM10Q96HG1 83 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 CMTM3Q96MX0 182 aa20.46■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 NUMA1Q14980 2115 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PRG6 482 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 FLRT2O43155 660 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 ARL6IP5O75915 188 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 PDGFAP04085 211 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 CPMP14384 443 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 CST6Q15828 149 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 THAP4Q8WY91 577 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 SERINC2Q96SA4 455 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAV27A0A087WT01 109 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX12O00623 359 aa20.45■□□□□ 0.86
HTATSF1-201ENST00000218364 SYPP08247 313 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms