RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr2mQ6P6I6 366 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Utp15Q8C7V3 528 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hyal3Q8VEI3 412 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr689Q8VG18 320 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpx6Q91WR8 221 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Laptm4bQ91XQ6 227 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lims1Q99JW4 325 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec13Q9D1M0 322 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam122cQ9D5J5 180 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asic5Q9R0Y1 495 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SnrpbP27048 231 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PtgirP43252 415 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RabggtbP53612 339 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 St3gal3P97325 374 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tamm41Q3TUH1 337 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elfn2Q68FM6 823 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr657Q7TRP7 319 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrtm4Q80XG9 590 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tm9sf4Q8BH24 643 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mchr1Q8JZL2 353 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galnt18Q8K1B9 622 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Park7Q99LX0 189 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc10a6Q9CXB2 373 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sgk3Q9ERE3 496 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SpastQ9QYY8 614 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NsdhlQ9R1J0 362 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lhx9Q9WUH2 397 aa15.01□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4779A0A1B0GR91 561 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HepacamQ640R3 418 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DraxinQ6PAL1 343 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr699Q7TRN3 316 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pomgnt2Q8BW41 605 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prdm9Q96EQ9 843 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scn2aA0A0J9YTW6 2006 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1700023F06RikA2AB62 382 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13178B1AVU7 408 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SelenonD3Z2R5 557 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cldn34aG3UW52 211 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r117K7N6V1 857 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smpd2O70572 419 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxd12P23812 268 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxd9P28357 339 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh4P39038 913 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35g3Q5F297 340 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snap91Q61548 901 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kiss1Q6Y4S4 130 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl31Q8BWA5 634 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc5a8Q8BYF6 611 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chchd4Q8VEA4 139 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr790Q8VGJ3 322 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itfg2Q91WI7 443 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gnpda2Q9CRC9 276 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clca3a2Q9EQR4 902 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc25a25A2ASZ8 469 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 5830473C10RikF8VQ07 620 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r109K7N747 858 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mc3rP33033 323 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sult2a2P50236 285 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgf1P61148 155 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sntb2Q61235 520 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ces2eQ8BK48 559 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb26Q8C8S0 451 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr164Q8VF87 315 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fmo4Q8VHG0 560 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asb8Q91ZT9 288 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arv1Q9D0U9 266 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srpk3Q9Z0G2 565 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SptbP15508 2128 aa15□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trav1A0A075B5Z4 110 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp978A2A7I1 335 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14399A2ARW8 610 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf39A2RT81 352 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8857L7N291 182 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gdi1P50396 447 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh10P70408 788 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Brf2Q3UAW9 420 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krba1Q6NXZ1 1043 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1275Q7TQY8 312 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C130079G13RikQ8BUY2 280 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LaynQ8C351 381 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SuoxQ8R086 546 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Egln3Q91UZ4 239 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpe65Q91ZQ5 533 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnk1Q99ML2 666 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrm2Q9CPY0 246 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3bgrlQ9JJU8 114 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bmp10Q9R229 421 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep290Q6A078 2472 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SpaarA0A1B0GSZ0 75 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdp1Q3UV70 538 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Samd14Q8K070 417 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dync2li1Q8K0T2 351 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo45Q8K3B1 286 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spns1Q8R0G7 528 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Osgin1Q8VC10 478 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr109Q8VG96 314 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab28Q99KL7 221 aa14.99□□□□□ -0.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pebp4Q9D9G2 242 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.8 ms