RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021056.7

Scn4a-201, Transcript of Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4a, Length 6,598 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4a-201ENSMUST00000021056 4933403O08RikF6UK53 379 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Zfp989H3BLB0 661 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 P01881 257 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 P01882 290 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Gabra2P26048 451 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Lim2P56563 173 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cyp2a12P56593 492 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Syndig1lQ3USQ7 237 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Dvl2Q60838 736 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Vangl1Q80Z96 526 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Slc5a7Q8BGY9 580 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cpne4Q8BLR2 557 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Lyrm4Q8K215 91 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Sirt3Q8R104 334 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cbx7Q8VDS3 158 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr1489Q8VFQ5 313 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ppp1r35Q9D8C8 260 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 FgaE9PV24 789 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Zfp169E9Q3R6 731 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Dusp8O09112 663 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Stc2O88452 296 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 AlplP09242 524 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Tap2P36371 702 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Pdcd1Q02242 288 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Znf865Q3U3I9 1058 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Znf235Q61116 645 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ptpmt1Q66GT5 193 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr1294Q8VGE5 312 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Samt4Q9D4X6 233 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Upk3bl1Q9D701 249 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr945Q9EQB5 319 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Jam2Q9JI59 298 aa8.99□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Grin3aA2AIR5 1135 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Vmn2r106E9PY92 862 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Vmn1r68E9Q0V3 319 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Aff2O55112 1272 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fcn1O70165 334 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Sec61a1P61620 476 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rhox4dQ2MDG0 205 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rhox4eQ504P9 205 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 B3gnt3Q5JCS9 372 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Sec22cQ8BXT9 303 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Zfp120Q8BZW4 436 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Agfg1Q8K2K6 561 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr446Q8VEV0 308 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr919Q8VF78 315 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr1033Q8VFK5 310 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr273Q8VG87 317 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Papd4Q91YI6 484 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Stard5Q9EPQ7 213 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Dap3Q9ER88 391 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Rhox4bQ9JI43 205 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 C1galt1c1Q9JMG2 316 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Serinc1Q9QZI8 453 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 FggyA2AJL3 552 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ankrd16A2AS55 361 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Prdm14E9Q3T6 561 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Vmn2r61L7N2B8 865 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PhyhO35386 338 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cops3O88543 423 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Sstr2P30875 369 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Gabrr1P56475 480 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Usf1Q61069 310 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Mea1Q64327 174 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Slitrk5Q810B7 957 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr569Q8VGZ2 314 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Emid1Q91VF5 444 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Steap4Q923B6 470 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr642Q924X8 314 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Map4k3Q99JP0 894 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cmtm8Q9CZR4 173 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Dnajb9Q9QYI6 222 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 PnckQ9QYK9 343 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Cst9Q9Z0H6 137 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr1493-ps1A0A140LHU2 316 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Znf518bB2RRE4 1077 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Vmn2r9K7N6Z8 848 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ifna1P01572 189 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Il5P04401 133 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ptger1P35375 405 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fmo5P97872 533 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 UbqlnlQ14DL0 610 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Fa2hQ5MPP0 372 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Sim1Q61045 765 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Ckmt2Q6P8J7 419 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr309Q7TS01 308 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 2810021J22RikQ8BIB6 539 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Vmn1r185Q8R299 319 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr1387Q8VFA9 311 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Golga7Q91W53 137 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Mdm1Q9D067 708 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Clic3Q9D7P7 237 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Znf536Q8K083 1302 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Olfr1215A3KGY3 312 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Dlgap4B1AZP2 992 aa8.98□□□□□ -0.97
Scn4a-201ENSMUST00000021056 Gm8444F6XS56 118 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms