RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640077.1

MED17-223, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 2,210 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-223	ENST00000640077	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077		Q6ZTK2	550 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	MON1A	Q86VX9	555 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	DHFR2	Q86XF0	187 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077		Q8NFD4	153 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ASB5	Q8WWX0	329 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	OTULIN	Q96BN8	352 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	MBOAT7	Q96N66	472 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	HBEGF	Q99075	208 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	SPAST	Q9UBP0	616 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077		A0A0B4J293	547 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077		A0A1W2PP18	115 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	WASH3P	C4AMC7	463 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	PTGES3L	E9PB15	166 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077		H0YIV9	168 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077		I6L893	689 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	CYB561D2	O14569	222 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	HSPA12A	O43301	675 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	TXNL1	O43396	289 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	RGS14	O43566	566 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	HCN1	O60741	890 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	DIRAS3	O95661	229 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	GSR	P00390	522 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	APRT	P07741	180 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	IL7R	P16871	459 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	LBP	P18428	481 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	TSPAN8	P19075	237 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	C4BPB	P20851	252 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	PAX6	P26367	422 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	PSMB9	P28065	219 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	PCGF2	P35227	344 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	WNT5A	P41221	380 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	TGM4	P49221	684 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	HTR6	P50406	440 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	BLK	P51451	505 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	CDH12	P55289	794 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	SLC26A5	P58743	744 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	RAB2A	P61019	212 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	SKP1	P63208	163 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ECH1	Q13011	328 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ALCAM	Q13740	583 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	PRPSAP1	Q14558	356 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	TTC23	Q5W5X9	447 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	REP15	Q6BDI9	236 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	EPGN	Q6UW88	154 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	CYS1	Q717R9	158 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ITFG1	Q8TB96	612 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	CCDC126	Q96EE4	140 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077		Q96MT0	163 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	REEP4	Q9H6H4	257 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	DYRK4	Q9NR20	520 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	VAPA	Q9P0L0	249 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	STUB1	Q9UNE7	303 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	AURKC	Q9UQB9	309 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077		V9GYQ6	96 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MED17-223	ENST00000640077	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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