RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 BAGE2Q86Y30 109 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 CFAP52Q8N1V2 620 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM163Q8TC26 289 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 FBXL20Q96IG2 436 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM82A0PJX8 343 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 JMJD7P0C870 316 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 C5AR1P21730 350 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 NUMBP49757 651 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 GP2P55259 537 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 BTNL8Q6UX41 500 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ASRGL1Q7L266 308 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 NRMQ8IXM6 262 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF485Q8NCK3 441 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF439Q8NDP4 499 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 NAT6Q93015 286 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ABCG8Q9H221 673 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 FBXL12Q9NXK8 326 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 FAM155BO75949 473 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 CSF2P04141 144 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 CSNK1DP48730 415 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ERVK-25P63136 954 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 FPGSQ05932 587 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 CRMP1Q14194 572 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 DUSP6Q16828 381 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM201Q5SNT2 666 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 TXNDC8Q6A555 127 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF425Q6IV72 752 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 FAM122AQ96E09 287 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 OR2T7P0C7T2 308 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 NAGAP17050 411 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ITGB8P26012 769 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 GABRA3P34903 492 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 RAB13P51153 203 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 OR2T27Q8NH04 317 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 V9GYS6 101 aa6□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 CHD1O14646 1710 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 TFPTP0C1Z6 253 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 TGM1P22735 817 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 G0S2P27469 103 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 DOC2AQ14183 400 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 SFT2D3Q587I9 215 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 LGI3Q8N145 548 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM18Q96B42 140 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 BOD1Q96IK1 185 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 OR8D2Q9GZM6 311 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF160Q9HCG1 818 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 CLDN5O00501 218 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 AHRP35869 848 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ADH7P40394 386 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 POU3F4P49335 361 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ADPRHP54922 357 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF852Q6ZMS4 543 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 FAM124AQ86V42 546 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 INIPQ9NRY2 104 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 THSD1Q9NS62 852 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 GPR34Q9UPC5 381 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 CALCBP10092 127 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 SDHBP21912 280 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 IGFBP4P22692 258 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 HLA-DMAP28067 261 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 TACR3P29371 465 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA1024LP59773 190 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 FUT2Q10981 343 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 APOFQ13790 326 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 MANEAQ5SRI9 462 aa5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SCN2A-209ENST00000636071 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms