RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 KCNE3Q9Y6H6 103 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PIP5K1BO14986 540 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 CHRNGP07510 517 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 RAC3P60763 192 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 BSPH1Q075Z2 132 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 DMTNQ08495 405 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TP53BP2Q13625 1128 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFAF6Q330K2 333 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A53Q5H9E4 307 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 OR56A1Q8NGH5 318 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 LIPT1Q9Y234 373 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 DTNAQ9Y4J8 743 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 DPRXA6NFQ7 191 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 THBS1P07996 1170 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 KRT16P08779 473 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 MAPK1P28482 360 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 CDKN1AP38936 164 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SELENBP1Q13228 472 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PGGHGQ32M88 737 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZT83 130 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 KBTBD8Q8NFY9 601 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 KIF18AQ8NI77 898 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PPP3R2Q96LZ3 170 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PSD2Q9BQI7 771 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM2Q9C040 744 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL9Q9P2J3 617 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PP18 115 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SLC7A1P30825 629 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 OR3A2P47893 321 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PTGR1Q14914 329 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 NATD1Q8N6N6 113 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 OR5W2Q8NH69 310 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 COQ8BQ96D53 544 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 CUBNO60494 3623 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PNR3 127 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 NPHS1O60500 1241 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PEX11AO75192 247 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf47O95873 294 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ACVR1BP36896 505 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 XKR7Q5GH72 579 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 DNM1P46Q6ZS02 220 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SFXN5Q8TD22 340 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS50Q9UI38 385 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ESPNB1AK53 854 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF264O43296 627 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 LYZL6O75951 148 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV4-39P01824 125 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 FESP07332 822 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ALDH3A1P30838 453 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 FAPQ12884 760 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 QPRTQ15274 297 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF614Q8N883 585 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 MOAP1Q96BY2 351 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SDF2Q99470 211 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 MKS1Q9NXB0 559 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 CR1P17927 2039 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 CYTIPO60759 359 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 CD8AP01732 235 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 UBL4AP11441 157 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 CBFBQ13951 182 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 C3orf30Q96M34 536 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 OR7D2Q96RA2 312 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf50Q9BV19 199 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 GRIP2Q9C0E4 1043 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 C9JVG2 144 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJA2O60884 412 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 RAMP1O60894 148 aa22.05■■□□□ 1.12
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