RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597023.1

PPFIA4-208, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 4, human

TSL 4

Gene PPFIA4, Length 496 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIA4-208	ENST00000597023	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023		E9PBE3	544 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	GSN	P06396	782 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	CD53	P19397	219 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	KLK2	P20151	261 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	ELK4	P28324	431 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	CDKN2C	P42773	168 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	FUT5	Q11128	374 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	SKP2	Q13309	424 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF141	Q15928	474 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	SAXO2	Q658L1	398 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZG16B	Q96DA0	208 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	MARK4	Q96L34	752 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	INPP5K	Q9BT40	448 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	AIG1	Q9NVV5	245 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PPFIA4-208	ENST00000597023	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	GOSR1	O95249	250 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	AK1	P00568	194 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	CSTA	P01040	98 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	THBD	P07204	575 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ENPP1	P22413	925 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	CRYGS	P22914	178 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ADH6	P28332	368 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	AGTR1	P30556	359 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ADAM8	P78325	824 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	CBFB	Q13951	182 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ATG16L1	Q676U5	607 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	FCRLA	Q7L513	359 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	RNF130	Q86XS8	419 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZFP90	Q8TF47	636 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	GJE1	A6NN92	205 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	HDAC3	O15379	428 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	H6PD	O95479	791 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	AGR2	O95994	175 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	NID1	P14543	1247 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLC7A1	P30825	629 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	RYK	P34925	604 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	PCYT1A	P49585	367 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	KHK	P50053	298 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	SESN3	P58005	492 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	CHRNE	Q04844	493 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PPFIA4-208	ENST00000597023	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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