RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579451.1

PSMD11-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 11, human

TSL 2

Gene PSMD11, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD11-208	ENST00000579451	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	THBS1	P07996	1170 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	KRT16	P08779	473 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	LAMP1	P11279	417 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ENPP1	P22413	925 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	MAPK1	P28482	360 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	CDKN1A	P38936	164 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ATP12A	P54707	1039 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	RAC3	P60763	192 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451		Q6ZT83	130 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	NATD1	Q8N6N6	113 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ZNF524	Q96C55	264 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	PLCE1	Q9P212	2302 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	DPRX	A6NFQ7	191 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ZNF264	O43296	627 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	NPHS1	O60500	1241 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	FES	P07332	822 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	CHRNG	P07510	517 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	SLC7A1	P30825	629 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ACVR1B	P36896	505 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	OR3A2	P47893	321 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	PTGR1	Q14914	329 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	PGGHG	Q32M88	737 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	MOAP1	Q96BY2	351 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	PRSS50	Q9UI38	385 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451		A0A1W2PNR3	127 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ESPN	B1AK53	854 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	CYTIP	O60759	359 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	PEX11A	O75192	247 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	C6orf47	O95873	294 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	CBFB	Q13951	182 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	QPRT	Q15274	297 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	XKR7	Q5GH72	579 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	COQ8B	Q96D53	544 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	OR7D2	Q96RA2	312 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	LYZL6	O75951	148 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	CD8A	P01732	235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	UBL4A	P11441	157 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	CCR4	P51679	360 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	FAP	Q12884	760 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	PPA1	Q15181	289 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	STK11	Q15831	433 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-208	ENST00000579451	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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