RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 PROK2Q9HC23 129 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 DEPPQ9NTK1 212 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 AP4S1Q9Y587 144 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 ATRXP46100 2492 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 PINLYPA6NC86 204 aa6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 TTLL8A6PVC2 850 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 FAAHO00519 579 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 FMO6PO60774 539 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 ADAM11O75078 769 aa6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 MAGEA2P43356 314 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 ZNF136P52737 540 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 MLLT10P55197 1068 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 TAS2R41P59536 307 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 VLDLRP98155 873 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 HOXC5Q00444 222 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 PMP22Q01453 160 aa6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 FOXO1Q12778 655 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 NPTX1Q15818 432 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF8-210ENST00000574217 TAAR6Q96RI8 345 aa6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 TRIM2Q9C040 744 aa6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 MED11Q9P086 117 aa6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.09□□□□□ -1.43
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PRPF8-210ENST00000574217 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.08□□□□□ -1.44
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PRPF8-210ENST00000574217 B4DXG7 233 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 J3KTA2 159 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 ACOT7O00154 380 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 GNGT2O14610 69 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 ADAMDEC1O15204 470 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
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