RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571507.5

P4HB-215, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 2

Gene P4HB, Length 493 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-215	ENST00000571507	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	HS3ST1	O14792	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	CLOCK	O15516	846 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	TYROBP	O43914	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	TMCC2	O75069	709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	STX11	O75558	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	CYP7B1	O75881	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	PRKD3	O94806	890 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	NTN1	O95631	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	LY6G6D	O95868	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	AGR2	O95994	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	CSTA	P01040	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SERPINE1	P05121	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	YES1	P07947	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	PAX1	P15863	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ENPP1	P22413	925 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ETV4	P43268	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	CLDN8	P56748	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	HPCA	P84074	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	EMX2	Q04743	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SKP2	Q13309	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	P2RY6	Q15077	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	GPR68	Q15743	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	2e-42	■■□□□ 14.5
P4HB-215	ENST00000571507	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SDF2	Q99470	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	EXD2	Q9NVH0	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	FREM3	P0C091	2139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	MED12	Q93074	2177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
P4HB-215	ENST00000571507		A0A1W2PNR3	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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