RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569192.5

BBS2-219, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-219	ENST00000569192	ALPP	P05187	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ALPPL2	P10696	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CCL11	P51671	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	NDST1	P52848	882 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	AP3M2	P53677	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	MYL5	Q02045	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	COX10	Q12887	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ENPP2	Q13822	863 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	P3H4	Q92791	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	LIME1	Q9H400	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	MYH11	P35749	1972 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	APC2	O95996	2303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192		A0A087WWV3	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SLC16A4	O15374	487 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TXNL1	O43396	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	MBTPS2	O43462	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SEC22B	O75396	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SYNGR4	O95473	234 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	MCF2	P10911	925 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	KRT5	P13647	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CCNC	P24863	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	GTF2H1	P32780	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ACY1	Q03154	408 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	MGAT3	Q09327	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	LPAL2	Q16609	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	HAGH	Q16775	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	RASL10A	Q92737	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	PSMB7	Q99436	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SH2D1B	O14796	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CHRNA1	P02708	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	HCK	P08631	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CLTA	P09496	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	KRT13	P13646	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ZNF24	P17028	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ACP1	P24666	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CASP1	P29466	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	GSK3B	P49841	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	PDK1	Q15118	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms