RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	C1QC	P02747	245 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ARAF	P10398	606 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ETS2	P15036	469 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	IL7R	P16871	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PGC	P20142	388 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RAC1	P63000	192 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RBBP4	Q09028	425 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NFYC	Q13952	458 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MAPK11	Q15759	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	HSPB2	Q16082	182 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MAPK14	Q16539	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	BBS10	Q8TAM1	723 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GPR119	Q8TDV5	335 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ST8SIA1	Q92185	356 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SLC35B4	Q969S0	331 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CGREF1	Q99674	301 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	IFT52	Q9Y366	437 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GJE1	A6NN92	205 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	C5orf58	C9J3I9	102 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549		H0Y3Z8	333 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	FAAH	O00519	579 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SNX3	O60493	162 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NTN1	O95631	604 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NUDT14	O95848	222 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	IL2RA	P01589	272 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	BCHE	P06276	602 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	UQCRB	P14927	111 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	IGFBP2	P18065	325 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ME2	P23368	584 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SEC24C	P53992	1094 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GNGT1	P63211	74 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SRY	Q05066	204 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MMEL1	Q495T6	779 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RNF220	Q5VTB9	566 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	REEP3	Q6NUK4	255 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	WNT2B	Q93097	391 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZG16B	Q96DA0	208 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM19	Q96HH6	336 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TRIB1	Q96RU8	372 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TM9SF2	Q99805	663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GID8	Q9NWU2	228 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PDZD2	O15018	2839 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	FBP2	O00757	339 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PGM3	O95394	542 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	IL18BP	O95998	194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CD1E	P15812	388 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PRKCA	P17252	672 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	DRD4	P21917	467 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SLC6A2	P23975	617 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MAP2K6	P52564	334 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	KRTAP10-9	P60411	292 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CDK6	Q00534	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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