RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 NR2F1P10589 423 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 KLK2P20151 261 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 PGM1P36871 562 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 CPA2P48052 419 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 STX1BP61266 288 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 FGFBP1Q14512 234 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 HBMQ6B0K9 141 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM200AQ86VY9 491 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 LURAP1LQ8IV03 231 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 OR2V1Q8NHB1 315 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 GTF2H4Q92759 462 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 OSTF1Q92882 214 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 C14orf79Q96F83 325 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 ITCHQ96J02 903 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 SRXN1Q9BYN0 137 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 PRRG4Q9BZD6 226 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 LAT2Q9GZY6 243 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 SAP130Q9H0E3 1048 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC38A1Q9H2H9 487 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 RNF122Q9H9V4 155 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 TPT1P8Q9HAU6 139 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 MCCC2Q9HCC0 563 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa12.85□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 AP3D1O14617 1153 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 NTN1O95631 604 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 AGR2O95994 175 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 CAPN3P20807 821 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 ME2P23368 584 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 HPCAP84074 193 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM27E3Q08E93 113 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 CBFBQ13951 182 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 AGKQ53H12 422 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 PAGE3Q5JUK9 113 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 C10orf111Q8N326 155 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF610Q8N9Z0 462 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 KLHL15Q96M94 604 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 CCDC28BQ9BUN5 200 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 RMND5AQ9H871 391 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC52A3Q9NQ40 469 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 RLIMQ9NVW2 624 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 KCNN3Q9UGI6 736 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 PACSIN3Q9UKS6 424 aa12.84□□□□□ -0.35
TM7SF3-211ENST00000542667 A8MXE2 369 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 ADAMDEC1O15204 470 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 KRT75O95678 551 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 BCHEP06276 602 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 CCNA2P20248 432 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 EIF1P41567 113 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 CARD18P57730 90 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 SESN3P58005 492 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 KCNJ10P78508 379 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 OR2A2Q6IF42 318 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 VRK2Q86Y07 508 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 MSRB3Q8IXL7 192 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 MAL2Q969L2 176 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 SPDL1Q96EA4 605 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 ZFP3Q96NJ6 502 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF175Q9Y473 711 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 MPDZO75970 2070 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa12.83□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A0G2JND7 137 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 TUBAL3A6NHL2 446 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 AGAP5A6NIR3 686 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 SYNGR4O95473 234 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 PLGP00747 810 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 CGAP01215 116 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 TFPTP0C1Z6 253 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 ZCCHC18P0CG32 403 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 DSTNP60981 165 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 LRRC74AQ0VAA2 488 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 MERTKQ12866 999 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 GUSBP1Q15486 140 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM71CQ8NEG0 241 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF563Q8TA94 476 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 ABHD3Q8WU67 409 aa12.82□□□□□ -0.36
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC38A5Q8WUX1 472 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms