RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	CSNK2B	P67870	215 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CDK16	Q00536	496 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CDH17	Q12864	832 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	COPS6	Q7L5N1	327 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456		A0A1W2PRD5	423 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456		A8MXQ7	604 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456		E7EWF7	191 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	PDE5A	O76074	875 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CDK14	O94921	469 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	SEC24A	O95486	1093 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	MYL2	P10916	166 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CCL2	P13500	99 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CALML3	P27482	149 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	MAP3K8	P41279	467 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	GNPDA1	P46926	289 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CRYBA2	P53672	197 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	RAB40B	Q12829	278 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ITPK1	Q13572	414 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	RCAN2	Q14206	197 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	GPR176	Q14439	515 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ITIH4	Q14624	930 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	NFATC4	Q14934	902 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	RAB35	Q15286	201 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	TAB1	Q15750	504 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF77	Q15935	545 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	PIM3	Q86V86	326 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	NRAC	Q8N912	160 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	USP16	Q9Y5T5	823 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	SIRPB1	O00241	398 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF195	O14628	629 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	INPP4B	O15327	924 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PRR4-209	ENST00000541456	HUS1	O60921	280 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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