RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SFXN2Q96NB2 322 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 WDFY2Q96P53 400 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CIPCQ9C0C6 399 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 LIPIQ6XZB0 460 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 SGSHP51688 502 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CAV3P56539 151 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 FXYD6P3P58550 94 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 H3F3AP84243 136 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ADIPOR2Q86V24 386 aa5.68□□□□□ -1.5
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