RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	PMM1	Q92871	262 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	MED20	Q9H944	212 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CASK	O14936	926 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	BET1	O15155	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	BRINP1	O60477	761 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CXCL14	O95715	111 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ABHD16A	O95870	558 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	HPX	P02790	462 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RRAS	P10301	218 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	NID1	P14543	1247 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SELENOP	P49908	381 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ATP12A	P54707	1039 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CLDN2	P57739	230 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	DGCR2	P98153	550 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RUNX2	Q13950	521 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	IL18	Q14116	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	STAC	Q99469	402 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	C12orf10	Q9HB07	376 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897		A0A087WV48	116 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	DOK2	O60496	412 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TPPP	O94811	219 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	UBL4A	P11441	157 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CPN1	P15169	458 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	EPCAM	P16422	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	TAS2R41	P59536	307 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	GPR162	Q16538	588 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CTSC-208	ENST00000533897	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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