RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF175Q9Y473 711 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 STX1BP61266 288 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RAC1P63000 192 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC74AQ0VAA2 488 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CBFBQ13951 182 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SGCBQ16585 318 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 LILRA2Q8N149 483 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2V1Q8NHB1 315 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2H4Q92759 462 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 STARD4Q96DR4 205 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ITCHQ96J02 903 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF559Q9BR84 538 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 LAT2Q9GZY6 243 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 TPT1P8Q9HAU6 139 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 HHATLQ9HCP6 504 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 NPHS2Q9NP85 383 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 POLE3Q9NRF9 147 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNN3Q9UGI6 736 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMDEC1O15204 470 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJA2O60884 412 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ANP32DO95626 131 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 GUSBP08236 651 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT7P0C024 238 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 NID1P14543 1247 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CCKARP32238 428 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CPA2P48052 419 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 HBMQ6B0K9 141 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM200AQ86VY9 491 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf111Q8N326 155 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 NRGNQ92686 78 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RMND5AQ9H871 391 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SLAMF8Q9P0V8 285 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DCTN4Q9UJW0 460 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CREBBPQ92793 2442 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 AP3D1O14617 1153 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 BCHEP06276 602 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 KLK2P20151 261 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ME2P23368 584 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF1P41567 113 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CRATP43155 626 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR2DL3P43628 341 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A53Q5H9E4 307 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 PAGE3Q5JUK9 113 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2A2Q6IF42 318 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC01560Q8TB33 94 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 MRGPRX4Q96LA9 322 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF385DQ9H6B1 395 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 AKAP6Q13023 2319 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PNR3 127 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 AGAP5A6NIR3 686 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT75O95678 551 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CGAP01215 116 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 NR2F1P10589 423 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 FCGR2AP12318 317 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RYKP34925 604 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SESN3P58005 492 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DSTNP60981 165 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SELENBP1Q13228 472 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SQLEQ14534 574 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ROBO4Q8WZ75 1007 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SPDL1Q96EA4 605 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJA3Q96EY1 480 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms