RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 OPALINQ96PE5 141 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 NDC1Q9BTX1 674 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 DPH1Q9BZG8 443 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52D1Q9H346 318 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OCEL1Q9H607 264 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ICAM5Q9UMF0 924 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 MED31Q9Y3C7 131 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GVG6 124 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GX78 115 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PQM1 296 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 FRG2CA6NGY1 282 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MUA0 341 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CCRL2O00421 344 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 BHLHE40O14503 412 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP33O14559 1287 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TO15178 435 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 RCBTB2O95199 551 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB36O95755 333 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ONECUT2O95948 504 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 HBQ1P09105 142 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CKMT1AP12532 417 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 LCN1P31025 176 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TGFBR1P36897 503 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 RFX3P48380 749 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TUBA1BP68363 451 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SPHARQ15513 63 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-BQ31612 363 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PERM1Q5SV97 790 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TUBA1AQ71U36 451 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 COX15Q7KZN9 410 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SLCO6A1Q86UG4 719 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR135Q8IZ08 494 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC34A3Q8N130 599 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 LNX2Q8N448 690 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2T33Q8NG76 320 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 BORCS5Q969J3 196 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 RNFT2Q96EX2 444 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF649Q9BS31 505 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 NUDT9Q9BW91 350 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 JAM3Q9BX67 310 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TGIF2Q9GZN2 237 aa9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OR51E2Q9H255 320 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 FGF21Q9NSA1 209 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CFL2Q9Y281 166 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SPTBP11277 2137 aa9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 METTL15A6NJ78 407 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SNTNA6NMZ2 147 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PATE3B3GLJ2 98 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 J3QRE1 110 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TM4SF5O14894 197 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SIGLEC6O43699 453 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 GPX5O75715 221 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC2A10O95528 541 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CSTAP01040 98 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 NGFRP08138 427 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 C1QTNF9P0C862 333 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 FUT1P19526 365 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 HTR1FP30939 366 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OPRL1P41146 370 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ETV5P41161 510 aa9.91□□□□□ -0.82
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