RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 SRRQ9GZT4 340 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SPACA6W5XKT8 324 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 HEATR5AQ86XA9 2040 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 TMCC2O75069 709 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 RFPL3O75679 317 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CTSEP14091 401 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 HHEXQ03014 270 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 EIPR1Q53HC9 387 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 OR13C2Q8NGS9 318 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 UFD1Q92890 307 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CCDC120Q96HB5 630 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PTCHD1Q96NR3 888 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 OR5K3A6NET4 321 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 FABP12A6NFH5 140 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 NCR1O76036 304 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CELP19835 753 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MAP3K8P41279 467 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 EMDP50402 254 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SMRP1Q8NCR6 262 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SETD6Q8TBK2 473 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 FANK1Q8TC84 345 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 KCTD7Q96MP8 289 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SNX18Q96RF0 628 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 TRAV27A0A087WT01 109 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 A0A087WV62 115 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 SHISA3A0PJX4 238 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 CENPBD1B2RD01 187 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 SLC30A4O14863 429 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 OR10H2O60403 315 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1D-16P01601 117 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 COL4A2P08572 1712 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 HTR1FP30939 366 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 UQCRC1P31930 480 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 SCN1BQ07699 218 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 FZD5Q13467 585 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 NNATQ16517 81 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 KIAA0895LQ68EN5 471 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 OR51A7Q8NH64 312 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 RFKQ969G6 155 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 RNF170Q96K19 258 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 DTX4Q9Y2E6 619 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PQ72 361 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 STK25O00506 426 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 BRINP1O60477 761 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 REM1O75628 298 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 TBXA2RP21731 343 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 KLHL12Q53G59 568 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 NOXA1Q86UR1 476 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 OOSP2Q86WS3 158 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 KLBQ86Z14 1044 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 TMEM99Q8N816 258 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 HS6ST2Q96MM7 605 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 FLRT3Q9NZU0 649 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 A0A0G2JNG1 304 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 GNB5O14775 395 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 IL1AP01583 271 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 HMGN1P05114 100 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 S1PR1P21453 382 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 KIR2DS5Q14953 304 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 PYDC2Q56P42 97 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms