RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 OR10H5Q8NGA6 315 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 RFWD2Q8NHY2 731 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 GPR119Q8TDV5 335 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 HTRA1Q92743 480 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 KCNK17Q96T54 332 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 CCT7Q99832 543 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 DUSP22Q9NRW4 184 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 TBK1Q9UHD2 729 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 FIS1Q9Y3D6 152 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 A0A1W2PPM1 405 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 RGS14O43566 566 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 HSPA4LO95757 839 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 RAC3P60763 192 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 PDE7AQ13946 482 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 CDC73Q6P1J9 531 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF614Q8N883 585 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF527Q8NB42 609 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 OR2T11Q8NH01 316 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 FCRL1Q96LA6 429 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 STACQ99469 402 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 PIGUQ9H490 435 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 E7EQL1 145 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 H3BNH8 94 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 PROCP04070 461 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 GGT1P19440 569 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 TTKP33981 857 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 NAA20P61599 178 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 SELENBP1Q13228 472 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 MZB1Q8WU39 189 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 BEX2Q9BXY8 128 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 RIPK2O43353 540 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 CYTIPO60759 359 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 GLRA3O75311 464 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 PGM3O95394 542 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 LINC00032P0C843 101 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 COX5AP20674 150 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ATP12AP54707 1039 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 DSCR9P59020 149 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 DNAJB13P59910 316 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 SPOCK1Q08629 439 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 QPRTQ15274 297 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 RAB35Q15286 201 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 GALNTL6Q49A17 601 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 DCST2Q5T1A1 773 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 SLC22A25Q6T423 547 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF525Q8N782 197 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 OR5B2Q96R09 309 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.97□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 A0A1W2PR80 420 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 OR5H1A6NKK0 313 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF724A8MTY0 619 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 RAD51DO75771 328 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 H6PDO95479 791 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 IGHV3-9P01782 118 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 C8BP07358 591 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF83P51522 516 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 CCR4P51679 360 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 CASP9P55211 416 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 VLDLRP98155 873 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 CHRNEQ04844 493 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 TP53BP2Q13625 1128 aa14.96□□□□□ -0.01
TOP3B-217ENST00000489581 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms