RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488550.5

MEIS1-209, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS1, Length 5,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-209ENST00000488550 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 CLN5O75503 358 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 OR2C1O95371 312 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 KNG1P01042 644 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 C6P13671 934 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 IRF2P14316 349 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM225Q6GV28 225 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 RGMBQ6NW40 437 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 NRMQ8IXM6 262 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 APH1BQ8WW43 257 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 RAB8BQ92930 207 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SGK3Q96BR1 496 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SORT1Q99523 831 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 CLMPQ9H6B4 373 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 Q9Y3F1 56 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM72A0PK05 275 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 AGPAT2O15120 278 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 FOLR1P15328 257 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 GPR4P46093 362 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 AGTR2P50052 363 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 CXADRP78310 365 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 P2RY14Q15391 338 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 LCTLQ6UWM7 567 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SPATC1Q76KD6 591 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 CDH26Q8IXH8 852 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 FRMD1Q8N878 549 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 IL17RCQ8NAC3 791 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF566Q969W8 418 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 MOCOSQ96EN8 888 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 NTMT1Q9BV86 223 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 HSPB2A8KAH6 182 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 PPP5D1E7EU14 171 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 JTBO76095 146 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 PPP1R3DO95685 299 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 BEX3Q00994 111 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 BDH1Q02338 343 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 CXCL9Q07325 125 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SLC14A1Q13336 389 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 HSPB2Q16082 182 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 BTNL8Q6UX41 500 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SLC39A7Q92504 469 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SAMD8Q96LT4 415 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 PCYT2Q99447 389 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.11□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 CHD1O14646 1710 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 FUCA1P04066 466 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF44P15621 663 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 NAT1P18440 290 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 DDCP20711 480 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 C5AR1P21730 350 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 FABP6P51161 128 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 ATP1B3P54709 279 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 HSD17B7P56937 341 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 GPLD1P80108 840 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SERTAD2Q14140 314 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 FCN2Q15485 313 aa7.1□□□□□ -1.27
MEIS1-209ENST00000488550 SGCAQ16586 387 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms