RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 SCGB1D2O95969 90 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 IL1AP01583 271 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ALPPL2P10696 532 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 G0S2P27469 103 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HOXC12P31275 282 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C2orf80Q0P641 193 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LCP2Q13094 533 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GTF2H3Q13889 308 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RPE65Q16518 533 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 THEM4Q5T1C6 240 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MTERF3Q96E29 417 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SCMH1Q96GD3 660 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GHRLQ9UBU3 117 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF222Q9UK12 451 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GTL3 188 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PPV9 198 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HYKKA2RU49 373 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C2orf74A8MZ97 194 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 B4E171 279 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 AIPO00170 330 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LDLRAD4O15165 306 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RPIAP49247 311 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NUDT6P53370 316 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ATP12AP54707 1039 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 KIAA0040Q15053 153 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SNAPC1Q16533 368 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF605Q86T29 641 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR2T11Q8NH01 316 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ASB11Q8WXH4 323 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CRB3Q9BUF7 120 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ACTL8Q9H568 366 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ASB8Q9H765 288 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GLRX2Q9NS18 164 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CD84Q9UIB8 345 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GVI7 797 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PRAMEF10O60809 474 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GADD45GO95257 159 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC6A1P30531 599 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RFC3P40938 356 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PTGFRP43088 359 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ARL14Q8N4G2 192 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SNX33Q8WV41 574 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MLXQ9UH92 298 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GPR160Q9UJ42 338 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PQM1 296 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PSMD9O00233 223 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HRGP04196 525 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SEMG1P04279 462 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HCKP08631 526 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ADRA2AP08913 450 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NMBP08949 121 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GZMMP51124 257 aa7.12□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GANABQ14697 944 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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