RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 SIX2Q9NPC8 291 aa4.81□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 MED17Q9NVC6 651 aa4.81□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CCL26Q9Y258 94 aa4.81□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.81□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 HES2Q9Y543 173 aa4.81□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa4.81□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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STRADBP1-201ENST00000478954 H0YL77 283 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 H3BMH7 237 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 KLF11O14901 512 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 BMP15O95972 392 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNE2O96020 404 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 UQCRC2P22695 453 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 AADACP22760 399 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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STRADBP1-201ENST00000478954 CAMK4Q16566 473 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC01620Q4KN68 170 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 Q6ZRG5 221 aa4.8□□□□□ -1.64
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STRADBP1-201ENST00000478954 DDHD1Q8NEL9 900 aa4.8□□□□□ -1.64
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STRADBP1-201ENST00000478954 HPDLQ96IR7 371 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF479Q96JC4 524 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 DCTN5Q9BTE1 182 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.8□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SPACA6W5XKT8 324 aa4.8□□□□□ -1.64
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STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0513O60268 411 aa4.79□□□□□ -1.64
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STRADBP1-201ENST00000478954 ANGPTL1O95841 491 aa4.79□□□□□ -1.64
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STRADBP1-201ENST00000478954 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.79□□□□□ -1.64
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STRADBP1-201ENST00000478954 CTAGE6Q86UF2 777 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 NFE4Q86UQ8 179 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 GPBP1Q86WP2 473 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC22A9Q8IVM8 553 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 EFCAB13Q8IY85 973 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC36Q8IYA8 594 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 MARVELD2Q8N4S9 558 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLGA5Q8TBA6 731 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 RDH11Q8TC12 318 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXO32Q969P5 355 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC41A3Q96GZ6 507 aa4.79□□□□□ -1.64
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STRADBP1-201ENST00000478954 LY9Q9HBG7 655 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF302Q9NR11 478 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 TAAR2Q9P1P5 351 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 LRP12Q9Y561 859 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAP6Q13023 2319 aa4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.78□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 UQCRHLA0A096LP55 91 aa4.78□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 NKX6-3A6NJ46 265 aa4.78□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 MEI4A8MW99 385 aa4.78□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 PPIAL4DF5H284 164 aa4.78□□□□□ -1.64
STRADBP1-201ENST00000478954 IMPA2O14732 288 aa4.78□□□□□ -1.64
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