RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473722.5

SCIN-205, Transcript of scinderin, human

TSL 4

Gene SCIN, Length 656 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCIN-205	ENST00000473722	MED8	Q96G25	268 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CENPK	Q9BS16	269 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	NDUFS4	O43181	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	DUX1	O43812	170 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	DCTN3	O75935	186 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CLDN9	O95484	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	RET	P07949	1114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CMPK1	P30085	196 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CDKN1A	P38936	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CAPZB	P47756	277 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	MFAP4	P55083	255 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	IRF8	Q02556	426 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	IFT88	Q13099	833 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	NR1D2	Q14995	579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	HLA-B	Q31612	363 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	NUMA1	Q14980	2115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722		A0A0G2JND7	137 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722		H0YIV9	168 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SLC28A1	O00337	649 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	AZIN1	O14977	448 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SLC22A2	O15244	555 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	TAPBP	O15533	448 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	FLRT2	O43155	660 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SNX3	O60493	162 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CHRNG	P07510	517 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	DCT	P40126	519 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CASP2	P42575	452 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	MMP15	P51511	669 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CCR8	P51685	355 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	ARFIP1	P53367	373 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	SKP1	P63208	163 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CBX1	P83916	185 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	RELA	Q04206	551 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	TGM3	Q08188	693 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SCIN-205	ENST00000473722	CHIT1	Q13231	466 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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