RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT8	Q9NY28	637 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF175	Q9Y473	711 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf72	A4D263	438 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	AQP8	O94778	261 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ETFA	P13804	333 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	PRKCA	P17252	672 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	PGC	P20142	388 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	PEX19	P40855	299 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	CARD18	P57730	90 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	FUT5	Q11128	374 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK14	Q16539	360 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	GPR119	Q8TDV5	335 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	NPHS2	Q9NP85	383 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ABCA4	P78363	2273 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0J9YW62	118 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	GJE1	A6NN92	205 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	BCHE	P06276	602 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	CHRM4	P08173	479 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TFPI	P10646	304 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	IL7R	P16871	459 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ELK4	P28324	431 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	SHC1	P29353	583 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A8	P48029	635 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	DSTN	P60981	165 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	MERTK	Q12866	999 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28	1e-16	■□□□□ 8.2
SSR4-208	ENST00000471880	SKP2	Q13309	424 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	GNA13	Q14344	377 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	AGK	Q53H12	422 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP90	Q8TF47	636 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	OSTF1	Q92882	214 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	ZG16B	Q96DA0	208 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	PROCR	Q9UNN8	238 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0G2JND7	137 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PNR3	127 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TNFSF13	O75888	250 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	CRH	P06850	196 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	CCNA2	P20248	432 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	KCNJ10	P78508	379 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	OR5B2	Q96R09	309 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf49	Q9H741	205 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	RNF122	Q9H9V4	155 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SSR4-208	ENST00000471880	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28

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