RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SMR3A	Q99954	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1B0GVL5	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	BUB1	O43683	1085 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KDELR3	O43731	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SELENOF	O60613	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LRCH4	O75427	683 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	IGSF6	O95976	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	C9	P02748	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CAPN1	P07384	714 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SPP1	P10451	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	UROS	P10746	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KRT5	P13647	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	COX6B1	P14854	86 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FOLR1	P15328	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LHCGR	P22888	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PTGER4	P35408	488 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NDST2	P52849	883 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MAPK12	P53778	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	GCNT1	Q02742	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ENPEP	Q07075	957 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	HERC3	Q15034	1050 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NUS1	Q96E22	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	C21orf140	B9A014	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FCGR3B	O75015	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LCA5L	O95447	670 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLC16A8	O95907	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	IVL	P07476	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	STS	P08842	583 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CD99	P14209	185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	HSD17B3	P37058	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KCNJ1	P48048	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CBX3	Q13185	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ART3	Q13508	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RIT1	Q92963	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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